Está ubicado en la Región de Atacama, ciudad de Copiapo.
El Museo nació en 1973 como iniciativa de la comunidad, que representada por una comisión cultural, propuso a las autoridades la creación de una entidad que llevara el nombre de Museo Regional de Atacama y de un comité que velara por su desarrollo. La Residencia de los Intendentes, en calle Atacama 630, albergó a la naciente institución.
Desde 1997, a través del Proyecto de habilitación, documentación y conservación de colecciones, la Institución experimentó un importante proceso de modernización, que se tradujo en la remodelación de sus espacios, la implementación de una nueva museografía con elementos interactivos; la adquisición de moderno equipamiento; el desarrollo de publicaciones y actividades de extensión; la instalación de un laboratorio de conservación, taller de registro y documentación; de depósitos de colecciones; un taller de diseño museográfico; y una sala múltiple.